|
|
来自沃勒姆研究所(OHSU)桑德斯实验室,一个构建组合DNA条码库的框架,使得基于探针的基因组学平台能够大规模跟踪和解码实验操作。
实验室描述了一种组合条码架构,使得使用768个探针解码约1680万个独特的RNA条码。团队与科学家合作,使用六个已知示例条码与狂犬病毒载体导入小鼠大脑,验证了体内解码。由于返回的是真实的x、y、z解码坐标而非二维投影,团队能够对条码特定解码事件进行评分,并利用三维空间聚类将这些点分割为单一视场内的264个独立神经元,恢复条码身份,并区分单次和多次感染事件。
条码可以轻松地用于单细胞分辨率的多种高度复用实验操作追踪,包括基因组级CRISPR筛查、谱系追踪和直接在完整厚组织中读取的突触网络重建。桑德斯实验室开发的组合条码设计与组装框架非常适合设计新型条码方案,以满足现有及未来基于探针的基因组学技术的需求。 |